Nature：新冠患者转为重症的预警因子被挖掘出

COVID-19病症的表现可以从无症状携带、轻症到需要呼吸机甚至体外上皮细胞肺氧合（ECMO）延续生命的危病患病人，这其中的关键决定性因素仍然有待破解。同时，新型冠状病原是否在传布流程中发生明显的基因突变，导致病原毒力和传染性的改变，也急需进一步图表比对。

自传染病爆发之后，复旦大学除此以外天津市嫡孙共卫生病理该中心（一般而言简称嫡孙卫该中心）与转化现代医学各地区重大科技基本嫡孙共设施（天津）（一般而言简称嫡孙共设施）、天津血液学图表比对所、现代医学序列学各地区综合麻省理工学院、瑞金医院病理病原学麻省理工学院，复旦大学天津药学院分子结构病原麻省理工学院、天津交通大学药学院除此以外同仁医院、中科院植物生理自然环境图表比对所、天津伯特兰图表比对所和天津营养与健康图表比对所等单位共同努力，就新型冠状病原序列、分子结构流行病学表现形式、病因病理特征透过了深入图表比对。

5月20日，《Nature》华尔街日报发表了这一制作团队的除此以外图表比对结果。具体来说，嫡孙卫生该中心卢洪洲教授与嫡孙共设施主任陈赛娟院士特为的联合攻关制作团队，收集了嫡孙卫该中心在2020年1月20日-2月25日之前收治的326事例病人骨骸，对病原序列变异、本病表现形式和病原体改变等图表透过了年底深度比对。

图表比对制作团队不断改进核心技术法则，高质量完成了112事例新冠病原序列测序、组装和解析。他们基于病原序列多肽的进化树比对推断出，新冠病原主要有两个分支（Clade I 和Clade II）。已确认有华南海鲜市场接触世界史的6事例病人除此以外集中在其中一个分枝中（Clade I），而Clade II病人无该接触世界史，提示COVID-19传染病的发生非常局限于华南海鲜市场。

新冠病原序列进化树

接着，通过对传染病频发的不同时间阶段和不同区域病人的新冠病原基因多肽（截至2020年3下半年）变异特征的比较比对，从天津个案分离的病原序列中识别了169个碱基改变，其重复注意到的突变与已嫡孙布的病原多肽一致，方形现较为有利于的进化流程，提示该病原可能在传染病早期就已适应在有机体体内中传布。同时他们推断出， 新冠病原两个分支的传布性、致病性和本病等方面无显著相似之处，未推断出与COVID-19病患病人有显著具体的病原变异多肽。

COVID-19病症白血球变化

图表比对人员从病理和生物化学图表比对推断出，COVID-19病人白血球明显下降，众所周知是病患病人CD4+和CD8+ T细胞方形显著性功能攀升渐进，且炎性细胞表征IL-6和IL-8明显增高。COVID-19病因持续发展致使程度的决定因素主要与病人岁数、基本病因及白血球下降和具体的细胞表征风暴密切具体，为病因向病患演变的关键预警表征。

这一图表比对结果意义甚深，对于进一步才是新型冠状病原的分子结构流行病特征、病因发生持续发展特性，为病患病症早期诊断和疗法，以及为药物和疫苗研发提供了重要的参考依据。

此外，图表比对制作团队还向中华人民共和国各地区组学图表系列丛书（The National Omics Data Encyclopedia，NODE） ()、全球传染病多肽图表库(GISAID)和NCBI的国际多肽图表库（SRA）递交了112个个案的新冠病原序列高质量多肽图表。同时，嫡孙共设施也搭建了重大病因大图表平台新冠病原序列图表交互式、开源在线比对com（）。国内外科研单位和科学界除此以外可显然包涵具体图表比对图表。

原始出处：

Xiaonan Zhang, Yun Tan, Yun Ling, et.al. Viral and host factors related to the clinical outcome of COVID-19. Nature 20 May 2020